Kobaiyr修道院在这里发现过青铜器和铁器时代的手工艺品，还曾发现过黄铜时代的工艺品。
Kobaiyr这个名字被认为是格鲁吉亚语“Kob”和亚美尼亚语“aiyr”的结合，意思是洞穴。确实也是，附近的山上布满了洞穴。
Kobaiyr是12世纪的年代史编者David Kobaiyretsi之故乡，也被Vartan Areveltsi和其他的作家们提及过，称这里是13世纪中期写作和文化的中心。它的历史和最有名的中世纪的一些封建家族-Kiurikians，Bagratunis和Zakarians有着密切的联系，Zakarians还曾把一种新的建筑风格引到这里。
修道院的主入口处有个拱形的通道和圆柱形的钟塔相连。主教堂，12世纪晚期的Katoghike是个部分已成废墟的单殿教堂。主入口门上雕刻着复杂的图形，外面雕刻着花纹等。这个教堂最显著的特色是华丽的壁画，现在仍然保存完好。
后殿的壁画排列成三排：顶部是圣母玛利亚和大天使，中间是圣餐，下面是圣徒和先知者们的画像。礼拜堂里也有壁画，同样是分成三排，分别是基督，圣餐和圣徒。
挨着Katoghikeh的，是较小的Mariamashen教堂，一半已成了废墟，它站在悬崖边上，是这个修道院建筑群里最古老的建筑。根据门口刻着的铭文，这个教堂于1171年为Kiurikeh二世的女儿-Mariam而建。
钟楼位于Katoghikeh的北部，在建筑群的中间，有一个方形的大厅和一个东方风格的后殿。根据南墙上的格鲁吉亚的铭文，1297年，Amirspasalar Shah的儿子和他的妻子Vaneni下令建造了这个钟楼。
钟楼的西侧是半废墟的13世纪的食堂，现在只有个矩形的大厅和几座墙及部分房顶保存了下来。 食堂的北边是一所12世纪的呈拱形房顶的单殿教堂。教堂附近是一个小礼拜堂的遗址。 |
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